Étude des parasites de la faune piscicole introduite et autochtone de Corse

Les impacts des espèces introduites sur les écosystèmes aquatiques sont multiples (e.g. compétition, prédation, modification d’habitat, impacts génétiques) et parmi ceux-ci, la co-introduction de pathogènes, dont les parasites, est particulièrement préoccupante et encore trop faiblement documentée.

Les objectifs du travail de cette thèse de doctorat étaient de (i) déterminer la composition de la parasitofaune des poissons natifs et introduits en Corse et évaluer sa richesse, (ii) déterminer si des transferts de parasites des poissons introduits vers les natifs ont pu se produire, et (iii) si les parasites présents sont susceptibles d’avoir un impact en termes de santé animale ou humaine.

Plusieurs espèces natives et introduites de poissons ont été sélectionnées : anguille, truite, blennie fluviatile, vairons, chevaine, goujons et perche, seulement trois principales ont fait l’objet d’une étude poussée (Fig. 2): l’anguille d’Europe (Anguilla anguilla), les vairons (Phoxinus spp.) et la perche (Perca fluviatilis).

La plupart des prélèvements de poissons ont été réalisés en rivière, par pêche électrique, avec l’appui de l’Office Français de la Biodiversité et de la Fédération pour la Pêche et la Protection du Milieu Aquatique. Des échantillons d’anguilles ont également été récupérés auprès des pêcheurs professionnels des lagunes de Biguglia et d’Urbino, et un échantillon de perche a été obtenu suite à un signalement de parasites par un usager du milieu, pêcheur récréatif.

L’anguille d’Europe est une espèce exploitée, en déclin depuis quatre décennies, et classée en danger critique d’extinction par l’Union Internationale pour la Conservation de la Nature (UICN). La fragilité des populations d’anguilles a conduit l’Union Européenne à exiger de ses États membres la mise en place de plans de gestion pour cette espèce. Plusieurs causes, anthropiques et naturelles, sont avancées pour expliquer le déclin de l’anguille : les obstacles à la migration, le changement climatique et les modifications des courants océaniques, la perte et la dégradation d’habitats, la pollution, la prédation et l'exploitation et le commerce légal et illégal. À ces causes, s’en ajoutent deux supplémentaires qui font l’objet de cette étude : les espèces invasives (libres ou parasites) et les maladies et parasites (Fig. 3) ont une influence sur la pertinence d’un milieu pour un éventuel repeuplement.

L’étude menée a permis de mettre en évidence trois résultats principaux :

1. la diversité parasitaire chez l’anguille en Corse est relativement faible, avec l’absence notable des acanthocéphales dans les cours d’eau de Corse ;
2. les parasites de l’anguille montrent des préférences vis-à-vis de l’habitat de leur hôte et de plusieurs paramètres biotiques et abiotiques (saison, âge, stade d’argenture). Par exemple, dans la lagune de Biguglia, les espèces les plus fréquentes et abondantes sont un copépode vivant dans les branchies de son hôte, et des espèces invasives : les monogènes Pseudodactylogyrus anguillae et Pseudodactylogyrus bini et le nématode Anguillicola crassus.
3. l’abondance et la prévalence des parasites invasifs a augmenté dans la lagune de Biguglia depuis la dernière décennie et la thèse de Jean-José Filippi (2013). Ils ont, de plus, été retrouvés dans la totalité des 11 cours d’eau étudiés. Il faut noter qu'A. crassus cause des dommages sur la vessie natatoire, un organe indispensable à l’équilibre du poisson et à sa migration pour la reproduction, et il est fréquemment cité comme l’un des facteurs contribuant au déclin de l’anguille.